de Brevern, Alexandre G: шукати на сайті Z-Library

Arefin, Ahmed Shamsul, Riveros, Carlos, Berretta, Regina, Moscato, Pablo, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 11.01 MB

english, 2018

GPU-FS-kNN: A Software Tool for Fast and Scalable kNN Computation Using GPUs

Журнал:

Kamath, Uday, De Jong, Kenneth, Shehu, Amarda, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.12 MB

english, 2012

Effective Automated Feature Construction and Selection for Classification of Biological Sequences

Журнал:

Simm, Dominic, Kollmar, Martin, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.01 MB

english, 2014

Waggawagga-CLI: A command-line tool for predicting stable single α-helices (SAH-domains), and the SAH-domain distribution across eukaryotes

Журнал:

Vincent Jallu, Mathilde Dusseaux, Simon Panzer, Marie-Françoise Torchet, Nathalie Hezard, Jenny Goudemand, Alexandre G. de Brevern, Cécile Kaplan

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.37 MB

english, 2018

αIIbβ3 integrin: new allelic variants in Glanzmann thrombasthenia, effects on ITGA2B and ITGB3 mRNA splicing, expression, and structure–function

Журнал:

Human Mutation

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 399 KB

english, 2010

Protein short loop prediction in terms of a structural alphabet

Manoj Tyagi, Aurélie Bornot, Bernard Offmann, Alexandre G. de Brevern

Журнал:

Computational Biology and Chemistry

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 288 KB

english, 2009

Analyzing the sequence–structure relationship of a library of local structural prototypes

Cristina Benros, Alexandre G. de Brevern, Serge Hazout

Журнал:

Journal of Theoretical Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.39 MB

english, 2009

Species specific amino acid sequence–protein local structure relationships: An analysis in the light of a structural alphabet

Alexandre G. de Brevern, Agnel Praveen Joseph

Журнал:

Journal of Theoretical Biology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1003 KB

english, 2011

Genome compartimentation by a Hybrid Chromosome Model (HχM). Application to Saccharomyces cerevisae subtelomeres

Alexandre G. de Brevern, France Loirat, Anne Badel-Chagnon, Cécile André, Pierre Vincens, Serge Hazout

Журнал:

Computers & Chemistry

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 447 KB

english, 2002

Protein secondary structure assignment revisited: a detailed analysis of different assignment methods

Juliette Martin, Guillaume Letellier, Antoine Marin, Jean-François Taly, Alexandre G de Brevern, Jean-François Gibrat

Журнал:

BMC Structural Biology

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 881 KB

english, 2005

Computational fragment-based drug design to explore the hydrophobic subpocket of the mitotic kinesin Eg5 allosteric binding site

Ksenia Oguievetskaia, Laetitia Martin-Chanas, Artem Vorotyntsev, Olivia Doppelt-Azeroual, Xavier Brotel, Stewart A Adcock, Alexandre G de Brevern, Francois Delfaud, Fabrice Moriaud

Журнал:

Journal of Cheminformatics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 145 KB

english, 2010

Analysis of loop boundaries using different local structure assignment methods

Manoj Tyagi, Aurélie Bornot, Bernard Offmann, Alexandre G. de Brevern

Журнал:

Olivia Doppelt-Azeroual, François Delfaud, Fabrice Moriaud, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 459 KB

english, 2009

Fast and automated functional classification with MED-SuMo: An application on purine-binding proteins

Журнал:

Catherine Etchebest, Cristina Benros, Serge Hazout, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.57 MB

english, 2010

A structural alphabet for local protein structures: Improved prediction methods

Журнал:

Cristina Benros, Alexandre G. de Brevern, Catherine Etchebest, Serge Hazout

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 843 KB

english, 2005

Assessing a novel approach for predicting local 3D protein structures from sequence

Журнал:

Juliette Martin, Alexandre G. de Brevern, Anne-Claude Camproux

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.22 MB

english, 2006

In silico local structure approach: A case study on Outer Membrane Proteins

Журнал:

Aurélie Bornot, Catherine Etchebest, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.19 MB

english, 2008

A new prediction strategy for long local protein structures using an original description

Журнал:

Aurélie Bornot, Catherine Etchebest, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 466 KB

english, 2009

Predicting protein flexibility through the prediction of local structures

Журнал:

Dorota Smolarek, Claude Hattab, Gholamreza Hassanzadeh-Ghassabeh, Sylvie Cochet, Carlos Gutiérrez, Alexandre G. de Brevern, Rachanee Udomsangpetch, Julien Picot, Magdalena Grodecka, Kazimiera Wasniows

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 803 KB

english, 2011

A recombinant dromedary antibody fragment (VHH or nanobody) directed against human Duffy antigen receptor for chemokines

Журнал:

Cellular and Molecular Life Sciences

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 837 KB

english, 2010

Influence of assignment on the prediction of transmembrane helices in protein structures

Jean Pylouster, Aurélie Bornot, Catherine Etchebest, Alexandre G. de Brevern

Журнал:

Amino Acids

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 971 KB

english, 2010

Computational fragment-based drug design to explore the hydrophobic sub-pocket of the mitotic kinesin Eg5 allosteric binding site

Ksenia Oguievetskaia, Laetitia Martin-Chanas, Artem Vorotyntsev, Olivia Doppelt-Azeroual, Xavier Brotel, Stewart A. Adcock, Alexandre G. de Brevern, Francois Delfaud, Fabrice Moriaud

Журнал:

Journal of Computer-Aided Molecular Design

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 364 KB

english, 2009

Extension of a local backbone description using a structural alphabet: A new approach to the sequence-structure relationship

Alexandre G. de Brevern, Hélène Valadié, Serge Hazout, Catherine Etchebest

Журнал:

The American Journal of Human Genetics

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 550 KB

english, 2002

A Dominant Mutation in the Gene Encoding the Erythroid Transcription Factor KLF1 Causes a Congenital Dyserythropoietic Anemia

Lionel Arnaud, Carole Saison, Virginie Helias, Nicole Lucien, Dominique Steschenko, Marie-Catherine Giarratana, Claude Prehu, Bernard Foliguet, Lory Montout, Alexandre G. de Brevern, Alain Francina, P

Журнал:

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 752 KB

english, 2010

Influence of microarrays experiments missing values on the stability of gene groups by hierarchical clustering

Alexandre G de Brevern, Serge Hazout, Alain Malpertuy

Журнал:

BMC Bioinformatics

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 888 KB

english, 2004

Use of a structural alphabet for analysis of short loops connecting repetitive structures

Laurent Fourrier, Cristina Benros, Alexandre G de Brevern

Журнал:

BMC Bioinformatics

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.60 MB

english, 2004

Comparative analysis of missing value imputation methods to improve clustering and interpretation of microarray experiments

Magalie Celton, Alain Malpertuy, Gaëlle Lelandais, Alexandre G de Brevern

Журнал:

BMC Genomics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.54 MB

english, 2010

Protein contacts, inter-residue interactions and side-chain modelling

Guilhem Faure, Aurélie Bornot, Alexandre G. de Brevern

Журнал:

Guilhem Faure, Aurélie Bornot, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 841 KB

english, 2008

Corrigendum to “Protein contacts, inter-residue interactions and side-chain modelling” [Biochimie 90 (4) (2008) 626–639]

Журнал:

Guilhem Faure, Aurélie Bornot, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 63 KB

english, 2008

Analysis of protein contacts into Protein Units

Журнал:

Agnel Praveen Joseph, N. Srinivasan, Alexandre G. de Brevern

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 867 KB

english, 2009

Improvement of protein structure comparison using a structural alphabet

Журнал:

Manoj Tyagi, Venkataraman S. Gowri, Narayanaswamy Srinivasan, Alexandre G. de Brevern, Bernard Offmann

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.23 MB

english, 2011

A substitution matrix for structural alphabet based on structural alignment of homologous proteins and its applications

Журнал:

Joseph, Agnel Praveen, Srinivasan, Narayanaswamy, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 232 KB

english, 2006

Progressive structure-based alignment of homologous proteins: Adopting sequence comparison strategies

Журнал:

Schneider, Bohdan, Černý, Jiří, Svozil, Daniel, Joseph, Agnel Praveen, Gelly, Jean-Christophe, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.80 MB

english, 2012

Bioinformatic Analysis of the Protein/DNA Interface

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 37 KB

english, 2011

Comparison of tertiary structures of proteins in protein-protein complexes with unbound forms suggests prevalence of allostery in signalling proteins

Swapna, Lakshmipuram S, Mahajan, Swapnil, de Brevern, Alexandre G, Srinivasan, Narayanaswamy

Журнал:

BMC Structural Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.21 MB

english, 2012

Understanding the role of domain–domain linkers in the spatial orientation of domains in multi-domain proteins

Bhaskara, Ramachandra M., de Brevern, Alexandre G., Srinivasan, Narayanaswamy

Журнал:

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 574 KB

english, 2013

mulPBA: an efficient multiple protein structure alignment method based on a structural alphabet

Léonard, Sylvain, Joseph, Agnel Praveen, Srinivasan, Narayanaswamy, Gelly, Jean-Christophe, de Brevern, Alexandre G.

Журнал:

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 420 KB

english, 2014

Cis–transpeptide variations in structurally similar proteins

Agnel Praveen Joseph, Narayanaswamy Srinivasan, Alexandre G. de Brevern

Журнал:

Amino Acids

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.19 MB

english, 2012

β-bulges: Extensive structural analyses of β-sheets irregularities

Craveur, Pierrick, Joseph, Agnel Praveen, Rebehmed, Joseph, de Brevern, Alexandre G.

Журнал:

Rebehmed, Joseph, Alphand, Véronique, de Berardinis, Véronique, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 799 KB

english, 2013

Evolution study of the Baeyer–Villiger monooxygenases enzyme family: Functional importance of the highly conserved residues

Журнал:

Esque, Jeremy, Oguey, Christophe, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.95 MB

english, 2013

A Novel Evaluation of Residue and Protein Volumes by Means of Laguerre Tessellation

Журнал:

Journal of Chemical Information and Modeling

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.52 MB

english, 2010

Modeling and molecular dynamics simulations of the V33 variant of the integrin subunit β3: Structural comparison with the L33 (HPA-1a) and P33 (HPA-1b) variants

Jallu, Vincent, Poulain, Pierre, Fuchs, Patrick F.J., Kaplan, Cecile, de Brevern, Alexandre G.

Журнал:

Mahajan, Swapnil, de Brevern, Alexandre G., Sanejouand, Yves-Henri, Srinivasan, Narayanaswamy, Offmann, Bernard

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.82 MB

english, 2014

Use of a structural alphabet to find compatible folds for amino acid sequences

Журнал:

Esque, Jeremy, Oguey, Christophe, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 9.16 MB

english, 2015

Comparative Analysis of Threshold and Tessellation Methods for Determining Protein Contacts

Журнал:

Journal of Chemical Information and Modeling

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.79 MB

english, 2011

Correlation between local structural dynamics of proteins inferred from NMR ensembles and evolutionary dynamics of homologues of known structure

Mahajan, Swapnil, de Brevern, Alexandre G., Offmann, Bernard, Srinivasan, Narayanaswamy

Журнал:

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 521 KB

english, 2014

Local dynamics of proteins and DNA evaluated from crystallographic B factors

Schneider, Bohdan, Gelly, Jean-Christophe, de Brevern, Alexandre G., Černý, Jiří

Журнал:

Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 195 KB

english, 2014

PRR Repeats in the Intracellular Domain of KISS1R Are Important for Its Export to Cell Membrane

Chevrier, Lucie, de Brevern, Alexandre, Hernandez, Eva, Leprince, Jérome, Vaudry, Hubert, Guedj, Anne Marie, de Roux, Nicolas

Журнал:

Molecular Endocrinology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.89 MB

english, 2013

Sequence–structure relationship study in all-α transmembrane proteins using an unsupervised learning approach

Esque, Jérémy, Urbain, Aurélie, Etchebest, Catherine, de Brevern, Alexandre G.

Журнал:

Amino Acids

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.56 MB

english, 2015

Conservation of structural fluctuations in homologous protein kinases and its implications on functional sites

Kalaivani, Raju, de Brevern, Alexandre G., Srinivasan, Narayanaswamy

Журнал:

Kalaivani, Raju, de Brevern, Alexandre G., Srinivasan, Narayanaswamy

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.40 MB

english, 2016

Cover Image, Volume 84, Issue 7

Журнал:

Noel, Floriane, Malpertuy, Alain, de Brevern, Alexandre G.

Рік:

2016

Файл:

PDF, 2.49 MB

2016

Global analysis of VHHs framework regions with a structural alphabet

Журнал: